生化自動分析儀根據儀器自動化程度的高低可分為全自動和半自動兩種，根據儀器反應裝置的結構原理可分為連續(xù)流動式、分立式、離心式和干式四類；根據選擇方式又有隨機任選式和固定項目式之分。隨機任選式就是多通道分析儀，是目前全自動生化分析儀的主流趨勢，干式分析儀也已逐漸走進臨床化學實驗室以至患者家庭，下面全自動生化分析儀廠家僅從流動式和分立式兩大類進行介紹。
流動式自動生化分析儀又可分為空氣分段系統(tǒng)和非分分段系統(tǒng)，前者是流動式分析儀中最典型的一種。
1．空氣分段系統(tǒng)
這種分析儀的特點是通過比飼定量泵擠壓彈性樣品管，空氣管和試劑管（通稱“泵管”），將樣品依次連續(xù)地吸人并沿樣品管輸送，另一方面由空氣管吸人的氣泡將由同樣原理吸入并在試劑管道中連續(xù)流動的試劑分成均勻的節(jié)段，樣品流和試劑流在連續(xù)向前流動的過程中相遇、混合、透吸（必要時）、保溫、反應及被測定。整個分析過程是液流在管道中連續(xù)流動的過程中完成的。
2．非分段系統(tǒng)
非分段系統(tǒng)是靠試劑空白或緩沖液來間隔每個樣品的反應液，這樣，在管道中連續(xù)流動的液體不被分段。非分段系統(tǒng)可再分為流動注入系統(tǒng)和間隙系統(tǒng)。
(1)流動注入系統(tǒng)：該系統(tǒng)的組成與空氣分段系統(tǒng)相似，但某些結構和工作原理有所不同，空氣分段系統(tǒng)是利用氣泡分段來防止管道中各反應液在流動過程中的交叉污染，而流動注入系統(tǒng)則是通過將樣品依次注入連續(xù)流動的試劑流管道中來達到防止交叉污染的目的的。
(2)間隙系統(tǒng)：該系統(tǒng)的結構、組成和工作原理與流動注入系統(tǒng)相似，但其特點是每一次進樣都必須在前一樣品的分析過程結束后（包括管道的清洗）才能開始，而不能連續(xù)地依次進樣，每次進樣同有一時間間隙，故有人稱為不連續(xù)流動式分析儀。
分立式自動生化分析儀是按手工操作的方式編排程序，以有節(jié)奏的機械動作代替手工，按順序依次操作的儀器，該類儀器的樣品和試劑在各自的試管（或反應杯）中進行，試管（反應杯）可兼作比色杯。該類儀器的恒溫器體積較大，要容納需保溫的試管或反應盤。分立式分析儀由單通道和多通道的，有固定項目式和隨機任選式，也有大、中、小型之分。
稱為第三代自動生化分析儀的離心式自動生化分析儀，也應屬于分立式。因為在離心式分析儀中，每個待測樣品都是在離心力作用下，在各自的反應槽內與試劑混合，并完成化學反應，繼而被測定的。離心式分析儀屬于“同步分析”，在離心力的作用下，各待測樣品幾乎同時與試劑混合、反應并被測定后打出報告；而其它分析儀是“順序分析”，即各待測樣品依次與試劑混合、反應先后被測定。
袋式自動生化分析儀也應屬于分立式，它是用試劑袋代替反應管和比色皿，漏定時每個待測樣品在各自的試劑袋內進行反應并被檢測。還有一種稱為“干式自動生化分析儀”也屬于分立式。它的主要特點是采用固相化學技術，即將試劑固相于膠片或濾紙小片等載體上，測定時使一定量的待測樣品分布于一張試紙片上，一定時間后用反射光度計測定。
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